【慶應義塾】タンパク質―RNA凝縮体を再現するRNA粗視化モデルの開発

－RNAが関与する新たな相分離機構を分子レベルで解明－

慶應義塾大学大学院理工学研究科の安田一希（博士課程2年）、同大学理工学部の山本詠士准教授、泰岡顕治教授、コペンハーゲン大学生物学部のクレステン・リンドルフ・ラーセン教授らの研究グループは、RNA粗視化分子モデルを開発し、タンパク質およびRNAが混ざり合って形成する生体分子凝縮体をシミュレーションにより再現することに成功しました。

タンパク質やRNAといった生体分子は、相分離現象により生体分子凝縮体を形成し、多様な生命現象に関与しています。本研究では、分子動力学シミュレーションに用いるRNAの粗視化モデルを開発し、さまざまな病理に関与するとされるタンパク質―RNA凝縮体のシミュレーションを可能にしました。これにより、RNAが関与する新たな相分離機構を分子レベルで解明しました。

本研究成果は、米国化学会の学会誌「Journal of Chemical Theory and Computation」に、2025年2月26日に発表されました。

▼全文は本学のプレスリリースをご参照ください。

https://www.keio.ac.jp/ja/press-releases/files/2025/3/3/250303-1.pdf