PubMed に日本語表示・検索と文献メモ機能を追加する、ブラウザ拡張機能 PubMedX【エミュイン合同会社】

全ての日本人医師や研究者が英語論文にアクセスしやすくなるようお手伝いします!

エミュイン

PubMedX は、PubMed の文献タイトルや抄録に和訳を追加するブラウザ拡張機能です。単にページ全体を翻訳するのではなく、必要な部分にのみ日本語を追加しますので、見やすさを保ったままで論文の内容を把握しやすくなります。
また、文献掲載誌のインパクトファクターの表示もできますので、重要な論文を効率よく見つけることができます。
Google Chrome や Microsoft Edge, Mozilla Firefox に無料でインストールしてお使いいただけます。
日本の医師や研究者の皆様の負担を減らし、より多くの最新の知見を得るために役立つツールとなるでしょう。

併せて、
 Reactive stat (https://www.emuyn.net/stats)
 NCD Helper (https://www.emuyn.net/ncdhelper)
 セキュア問診票 (https://www.emuyn.net/q4cl)
 手術ビデオ専用サーバー (https://www.emuyn.net/opvs)
 学術団体DXシステム
もよろしくお願いします。
  • PubMedX 拡張機能のご紹介

 PubMedとは米国国立医学図書館(NLM)が作成する、MEDLINE(メドライン)を含む医学分野の代表的な文献情報データベースです。
 このMEDLINE では世界中の5,200 誌以上の雑誌に掲載された文献情報を検索できます。
 
 PubMed はほぼ全て英語ですので、日本人にはやや敷居が高いです。
 PubMedX は、PubMed のページ内の文献タイトルおよび抄録部分を英日翻訳して、ページ内に表示してくれます。
 ページ全体を翻訳するのとは異なり、英語の情報が保たれているため内容の把握が容易となります。
 日本語を読む方が英語を読むよりも早い大部分の日本人において、日常的な文献検索にかかる時間とストレスは大幅に軽減されるでしょう。
 
 PubMedX は、この PubMed を使い倒すための拡張機能で、以下の機能を備えています。
 ・文献タイトルおよび抄録部分を英日翻訳して、ページ内に表示します。
 ・Impact Factor を色分けして表示します。
 ・Open access の PDF が入手可能である場合には、PDF へのリンクボタンを表示します。
 ・ページ全体を Google 翻訳するためのボタンを表示します。
 ・論文にメモを記録できます。
 ・PubMed ID や DOI を含む URL への独自リンクボタンを設定できます。

 
 詳細は https://www.emuyn.net/pubmedx/index をご覧ください。
 
 Google Chrome ウェブストアから Chrome または Edge にインストール
 https://chrome.google.com/webstore/detail/pubmedx/ndbnmjocnckdijnlnkoponigbnfmalpi/
 
 Firefox ADD-ONS から Firefox にインストール
 https://addons.mozilla.org/ja/firefox/addon/emuyn_pubmedx/
 
 なお、現在、スマホ用の Google Chrome は拡張機能をサポートしておりませんのでご利用になれませんが、Android では Kiwi Browser を利用することで PubMedX をご利用になれます。
  

  •  PubMedX による機能追加

PubMed 検索ページPubMed 検索ページ


 検索ページでは、日本語で検索できるようになります。 検索窓に入力した日本語は自動的に英語に変換されて検索が実行されます。
 
 検索結果の文献タイトルには、その下の行に和訳が追加されます。
 
 文献掲載誌のインパクトファクター (IF) が表示されるようになり、より重要な文献を見つけやすくなります。 IF の高いものは緑の背景色が濃く表示されます。
  

PubMed 文献表示PubMed 文献表示


 個別の文献表示においては、抄録部分の和訳が英文抄録の下に追加されます。
 
 また、右側のリンクエリアにはいくつかのリンクボタンが追加されます。
 ・オープンアクセスの PDF が存在する場合にはそのファイルへのリンクボタン、もしくはそのフルテキストページへのリンクボタン
 ・ページ全体を翻訳するためのリンクボタン
   現在表示中のページを Google 翻訳で表示します。
 ・Mendeley 連携リンクボタン
   多くの大学などで利用されている文献管理システムの Mendeley ウェブ版に、表示されている文献を追加できます。文献の DOI (デジタルオブジェクト識別子) が明示してある場合に表示されます。
 ・PMC (PubMed Central) を翻訳するためのリンクボタン
   PMC にてフルテキストが無料公開されている場合には、そのページを Google 翻訳で表示します。
 ・独自リンクボタン
   ユーザーごとに独自のリンクボタンを設定できます。設定方法は後述します。
  

  • インストール

 インストールは、Google Chrome ウェブストア もしくは Firefox ADD-ONS サイトから行います。
 
 インストール後はいつも通りに PubMed を利用すれば、全ての文献タイトルと抄録に日本語訳が付加されます。
 
 Google Chrome へのインストール
 インストールは、Google Chrome ウェブストア から行います。
 https://chrome.google.com/webstore/detail/pubmedx/ndbnmjocnckdijnlnkoponigbnfmalpi/
 上記リンクをクリックすると PubMedX のページが開きますので、右上のボタンからインストールしてください。
  

Google Chrome ウェブストアGoogle Chrome ウェブストア


 Microsoft Edge へのインストール
 NCD Helper は Microsoft store には登録されておらず、Chrome ウェブストアに登録されている Chrome 用の拡張機能を利用していただくことになりますので、 Google Chrome ブラウザの拡張機能を Microsoft Edge にインストールするための設定が必要です。
 https://chrome.google.com/webstore/detail/pubmedx/ndbnmjocnckdijnlnkoponigbnfmalpi/
 
 Chrome ウェブストアから Microsoft Edge に NCD Helper 拡張機能を追加するには:
 
 ・Google Chrome ウェブストアにアクセスします。

 ・ページの上部にあるバナーの [他のストアからの拡張機能を許可する] を選択します。
 ・NCD Heler 拡張機能の [Chrome に追加] を選択します。
 ・拡張機能に必要なアクセス許可を表示するプロンプトで、アクセス許可を確認し、[拡張機能の追加] ボタンを選択します。拡張機能が追加されたことを確認する最後のプロンプトが表示されます。
 
 Mozilla Firefox へのインストール
 インストールは、Firefox ADD-ONS サイトから行います。
 https://addons.mozilla.org/ja/firefox/addon/emuyn_pubmedx/
 上記リンクをクリックすると PubMedX のページが開きますので、右上のボタンからインストールしてください。
  

Firefox ADD-ONS サイトFirefox ADD-ONS サイト

   

  • オプション設定

 インストールしますとオプション設定画面が開きますので、以下の機能の設定を行ってください。
 設定内容は、設定を保存して反映 ボタンを押すと反映されます。
 
 日本語で PubMed を検索できるようにする
 検索文字列に日本語が入力されると、英語に翻訳して検索します。
 
 インパクトファクター (IF) を表示する
 文献掲載誌のIFを表示します。緑色が濃いものはIFの高いものです。
 
 インパクトファクター (IF) とは?
 特定の1年間において、特定の雑誌に過去2年間に掲載された論文が平均的にどれくらい頻繁に引用されているかを表す尺度です。 学術誌の影響度を表し、同分野の他の雑誌と、重要度を相対的に比較することができます。
 ・その雑誌に掲載された個々の論文の評価指標ではありません。
 ・引用頻度や傾向は分野ごとに異なるため、異分野間の比較はできません。
 ・レビュー論文は引用されやすいため、レビュー誌はインパクトファクターが高く算出される傾向にあります。
 ・インパクトファクターは、クラリベイト・アナリティクス社が選考した学術誌を対象として算出されます。
 
 論文メモ機能
 PubMed で開いている論文にメモを記録できるようにするかどうかを設定できます。
 大事だなと思う論文に出会ったときに、さっとメモを書き込んでおくだけで後で簡単に見返すことができるようになります。
 各論文のページに、メモを記録するための領域が表示され、自由にメモを書き込むことができます
 「論文メモ一覧」のボタンから開いたページからは、メモを付けた論文リストの一括ダウンロードができます。 ファイルは CSV 形式ですので、エクセルなどで読み込むことができます。
 
 独自リンクボタンの追加
 論文の PMID (PubMed ID), DOI (デジタルオブジェクト識別子) を利用して、独自にリンクボタンを設定することができます。
  

  • 利用者から機能追加のご要望があればできるだけ応えてゆきます

 この拡張機能は、もともと、当社所属の医師が日常の文献検索で活用するために開発したものです。 過去には「自動翻訳の英語なんてわかりにくいだけ」との認識で全て英語で読んでおりましたが、最近のAI技術の進化により、自動翻訳の日本語が大変わかりやすくなってきたため、最近では論文の zapping に翻訳ページを積極的に利用するようになりました。 しかし、やはりページ全体を翻訳してしまうと、逆に見づらくなるので、翻訳ページと原文を行ったり来たりする必要があり面倒でした。 その結果、PubMedX の開発に至ったわけです。
 
 PubMedX を利用し始めると、その医師は日本語を理解する方が英語よりも圧倒的に早いため、大幅な時間の節約につながりました。 また、ストレスも少ないために頼多くの最新の論文に接することができるようになったそうです。
 
 実際のところ、PubMedX を無料で一般公開すると、サーバー費用や自動翻訳 API の利用料金の負担が当社に生じるわけですが、それにもまして医師や研究者の皆様のお役に立つことができ、ひいては日本の医学研究の発展にわずかでも貢献できると考えて、このたびの無料公開に踏み切りました。
 
 そのような背景ですので、利用者の皆様からの機能追加のリクエストにはできるだけ応えてゆきたいと考えています。 ぜひ、PubMedX をより便利にするアイデアをお寄せくださいますようお願いいたします。
  

  • 機能追加してバージョンアップしました (2022/6/1)

​オープンアクセスの PDF が存在する場合にはそのファイルへのリンクボタン、もしくはそのフルテキストページへのリンクボタンが表示されるようになりました。
 従って、原本を入手するための手間が大幅に削減されます。
 
 論文メモ機能を実装しました。
 各論文のページに、メモを記録するための領域が表示され、自由にメモを書き込むことができますので、大事だなと思う論文に出会ったときに、さっとメモを書き込んでおくだけで後で簡単に見返すことができるようになります。
 「論文メモ一覧」のボタンから開いたページでは、メモ内容から論文内容を検索して絞り込むことができます。また、メモを付けた論文リストの一括ダウンロードができます。 ファイルは CSV 形式ですので、エクセルなどで読み込むことができます。
 非常に便利ですので、ぜひご活用ください。
 
 独自リンクボタンを追加する機能を実装しました。
 PubMedX の機能をユーザーが拡張することが可能になりました。
 
 (このバージョンアップは Chrome および Edge版のみとなります。ブラウザ対応状況の制約により Firefox版への機能追加はしばらくお待ちください)
  

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 ・ 利用料金は安価に設定してあり、最少のコストで運用可能です。導入費用はかかりません。
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設立
2021年05月