日本人を対象とした腸内細菌叢プロファイルに関する論文が「Microorganisms」誌に掲載

日本人の腸内細菌叢タイプを定義し、疾患との関連性を評価：健康な人から様々な疾患を持つ人まで、多数の日本人を対象とした腸内細菌叢解析を実施

＜研究のポイント＞
◆日本人のみを対象とし、背景情報を取得した十分な数の対象者を確保している
◆300名弱の健常者に加え、10を超える疾患罹患者も対象者としている
◆全ての検体の腸内細菌叢解析を全く同じ手法で行っている

京都府立医科大学、摂南大学、株式会社プリメディカは、三者共同研究「腸内細菌叢研究データベースの統合的解析による腸内環境評価システムの開発」（以下「本研究」）を実施し、本件に関する論文が学術雑誌『Microorganisms』に2022年3月20日付で掲載されました。（https://www.mdpi.com/2076-2607/10/3/664/html）

健康な人から様々な疾患を持つ人まで、多数の日本人を対象とした腸内細菌叢プロファイルに関する報告は、我々の知る限り、本研究が初めてとなる成果です。

本研究では、全く同じ手法で腸内細菌叢を解析した16の臨床研究で得られた、合計1,803名分の日本人の健常者と疾病有病者の腸内細菌叢データの統合解析を行うことで、日本人腸内細菌叢データベースを構築しました。

 【論文概要】
1.研究の背景
近年、分子生物学的手法を駆使した腸内細菌叢解析の発達により、腸内細菌叢の全容が明らかにされつつあり、様々な疾病との関わりも示唆されております。しかし、従来の腸内細菌叢の研究においては、人種や食生活など、背景にある環境因子の影響を大きく受けることや、測定においても前処理技術などの違いにより結果の解釈が分かれることが課題となっておりました。

2.研究の成果
本研究ではAI（人工知能）を用いて、⽇本⼈に最適なエンテロタイプ※1の解析に着⼿し、38細菌属の存在比率に基づき5つのタイプ（Type A～E）に定義図1し、各タイプと疾患との関連性図２を明らかにしました。
最も健常者が多かったType Eのプロファイルをもとに、各疾患のオッズ比※2を算出し、健常者が少ないType A、 Type Dでは、様々な疾患との関連が示されました。Type Aでは、循環器系疾患、神経系疾患、生活習慣病で特に高いオッズ比を示し、Type Dでは、炎症性腸疾患（IBD）、機能性胃腸障害で高いオッズ比を示しています。
※1 腸内細菌叢の特徴を表す指標
※2 ある事象の起こりやすさを２つの群で比較して示す際の指標

3.今後の展望
今後は本研究成果を社会実装した腸内細菌叢検査サービス「Flora Scan」を通して、引き続き研究を⾏いながら更なるデータを収集し、腸内細菌叢改善効果のある食品機能性等の研究における標準的な評価指標として、幅広く⽤いられることを目指します。


図1:（38細菌属の存在比率に基づいた5つのタイプ分け）
最も健常者が多かったType Eは食物繊維の摂取と関連性が深いと考えられているPrevotella属の存在比率の高さが特徴的です。

図2:（エンテロタイプと各疾患との関連性）
Type DはBifidobacterium属の平均占有率が約20%と顕著に高くなることが特徴的なタイプで、IBDのオッズ比が27倍と非常に高値です。Type Aは複数の疾患で有意に高いオッズ比を示しています。

 

 

掲載誌情報	雑誌名 Microorganisms 発表媒体 ■ オンライン速報版 □ ペーパー発行 □ その他 雑誌の発行元国 スイス オンライン閲覧 可 URL：https://www.mdpi.com/2076-2607/10/3/664/html 論文掲載日 現地時間：2022 年3月20日付
論文情報	論文タイトル 「Typing of the Gut Microbiota Community in Japanese Subjects」 代表著者（所属・氏名） 京都府立医科大学大学院医学研究科　医療フロンティア展開学　髙木智久 共同著者（所属・氏名）※論文掲載順 摂南大学農学部　応用生物科学科　動物機能科学研究室　井上亮 株式会社プリメディカ　大島彬 株式会社プリメディカ　坂爪洋 株式会社プリメディカ　小川健太 株式会社プリメディカ　富永朋 株式会社プリメディカ　三原洋一 京都府立医科大学大学院医学研究科　消化器内科学　菅谷武史 京都府立医科大学生体免疫栄養学講座　水島かつら 京都府立医科大学大学院医学研究科　消化器内科学　内山和彦 京都府立医科大学大学院医学研究科　消化器内科学　伊藤義人 京都府立医科大学生体免疫栄養学講座　内藤裕二
研究課題	研究課題名 「腸内細菌叢研究データベースの統合的解析による腸内環境評価システムの開発」 研究者責任者（所属・氏名） 京都府立医科大学大学院医学研究科 医療フロンティア展開学 髙木智久 研究担当者（所属・氏名） 京都府立医科大学生体免疫栄養学講座　内藤裕二 京都府立医科大学大学院医学研究科 消化器内科学 内山和彦 共同研究機関（所属・氏名） 摂南大学農学部　応用生物科学科　動物機能科学研究室　井上亮 株式会社プリメディカ　研究開発グループ

​■本件に関するお問い合わせ先

＜研究に関すること＞	＜広報に関すること＞
京都府立医科大学大学院医学研究科 医療フロンティア展開学 准教授 髙木智久 Tel：[phone] Email：[e-mail]	京都府立医科大学 企画広報課 土屋 Tel：[phone] Email：[e-mail]
摂南大学農学部 応用生物科学科 動物機能科学研究室 教授 井上亮 Tel：[phone] Email：[e-mail]	学校法人常翔学園 広報室（摂南大学担当） 坂上、大野 Tel：[phone] Email：[e-mail]
株式会社プリメディカ 検査管理部 研究開発グループ 大島 彬 Tel：[phone] Email：[e-mail]	株式会社プリメディカ 事業企画部 小川 健太 Tel：[phone] Email：[e-mail]