安全性評価に高速塩基配列検索ソフトGGGenomeパッケージ版を導入
クラウド型ゲノム編集支援オープンプラットフォーム「Genome Editing Cloud」における安全性評価に「GGGenomeパッケージ版」を導入
株式会社レトリバ(本社:東京都新宿区、代表取締役 河原一哉)は高速塩基配列検索「GGGenome パッケージ版」がプラチナバイオ株式会社(本社:広島県東広島市、代表取締役CEO:奥原 啓輔、以下「プラチナバイオ」)に導入されたことをお知らせします。
- 導入背景
GGGenomeパッケージ版は、シンプルな静的APIを備えており、クラウドサービスと連携させることも容易で、安全性評価に必要な縮重塩基表記やギャップ(バルジ)型オフターゲットの検索といった複雑な要求に対応できました。さらに公共データベースに掲載されているゲノムだけでなく、企業や研究者が解読したゲノム情報や独自に持っているゲノム情報をデータベースに追加することが可能なため、商用サービス用途での安全性評価にも対応可能となるとの評価をいただきました。
https://gggenome.retrieva.jp/exam_ptbio
- プラチナバイオについて
特にバイオDX事業では、ゲノム解析・RNA-seq技術を活用し、CRISPR-Cas9・TALEN・ZFNを含めたゲノム編集ターゲットの特定サービスを展開しています。本取組とのコラボレーションによりゲノム解析から編集まで一気通貫で行えるトータルパッケージを提供し、付加価値の大きなものづくりの実現を目指します。
代表:代表取締役 CEO 奥原 啓輔
所在地:広島県東広島市鏡⼭三丁⽬10番23号
https://www.pt-bio.com/
- GGGenome パッケージ版について
製品紹介サイトでは、GGGenome 開発者であるDBCLS内藤特任助教のインタビュー記事や一般社団法人化学物質評価機構(CERI)での導入事例も紹介しております。
https://gggenome.retrieva.jp
- 株式会社レトリバについて
所在地:東京都新宿区西新宿2-1-1 新宿三井ビル32階
代表者:代表取締役 河原 一哉
資本金:1億円
事業内容:自然言語処理及び機械学習を用いたソフトウェアの研究・開発・販売・導入およびサポート
https://retrieva.jp/
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